Ученые создают вычислительный аппарат для большего понимания метаболической сети

«Отечественное изучение принципиально важно, по причине того, что мы желаем осознать не только сотрудничества между клетками животных и бактериями, таковой как, как они происходят в отечественном пищеварительном тракте, но вправду как разные пищевые компоненты содействуют производству биомассы либо энергии», сообщила Мэриан Уолхут, врач философии, учитель молекулярной медицины и соруководитель Программы в области Системной биологии.Подробности iCEL1273 сети (что содержит 1 273 гена, 623 метаболических реакций 1 985 и фермента) были изданы 19 мая 2016 в издании Cell Systems.В газете, враче Уолхуте и Латфу Сэфэке Йилмэзе, врач философии, учитель изучения в молекулярной медицине, воображает первую реконструкцию масштаба генома C. elegans метаболическая сеть и говорит о том, что при помощи iCEL1273, ученые смогут применять математическое моделирование, дабы преобразовать бактериальную диету в биомассу.

«Мы создали метаболический замысел действий, дабы трактовать отечественные результаты в лаборатории и можем пойти свободно назад и вперед между животным и что это глотало. У нас сейчас имеется вычислительный метод преобразовать диету в энергию и биомассу», сообщил Уолхут.Применяя названный анализ баланса потока математического инструмента вместе с iCEL1273, ученые вычислили разные дороги, каковые питательные вещества, когда-то потребляемые, имели возможность забрать в их преобразовании в биомассу у червя и какая пропорция каждого маршрута употребляется. Они кроме этого смогли сделать предсказания на уровне совокупностей, того, как червь отвечает на отдельные питательные вещества, каковые не могли быть сделаны лишь опытами во мокрой лаборатории, сообщил Уолхут.

Новая сеть может употребляться в качестве подтверждающего инструмента для работы, уже законченной в лаборатории, но что еще более принципиально важно, это может употребляться в качестве нового прогнозирующего инструмента, дабы трактовать эти и начать новые проекты.«Мы можем в вычислительном отношении угадать, какие конкретно гены в данной метаболической сети ответственны для червя, дабы вырасти», сообщил врач Йилмэз.Безграничное видение для новой сети должно взять более глубокое познание, и систематически и механически, следствия и причины переделывания бактерий, каковые ест червь.«Это может дать догадки, что мы можем тогда экстраполировать и в вычислительном отношении проверить в людской сети.

Это разрешит нам видеть то, в случае если и что мы находим во сотрудничестве между бактериями, и черви смогут перевести к сотрудничествам между человеческими клетками и бактериями пищеварительного тракта», сообщил Уолхут.

10 комментариев к “Ученые создают вычислительный аппарат для большего понимания метаболической сети”

Оставьте комментарий