Новая компьютерная программа может помочь раскрыть скрытые геномные изменения, которые ведут раковые образования: Проверенный на большой базе данных геномики опухоли, метод REVEALER позволяет исследователям соединять геномику с функцией клетки

Данный инструмент, обрисованный в работе, опубликованной 18 апреля по собственной природе Биотехнология, создан, дабы оказать помощь исследователям выяснить группы наследственной изменчивости, которая совместно связывается с конкретным методом, которым раковые клетки активированы, либо как они поддаются определенному лечению. REVEALER дешёв безвозмездно глобальному научному сообществу через портал ПО биоинформатики GenePattern.org.«Данный вычислительный аналитический способ действенно раскрывает функциональный контекст геномных трансформаций, таких как генные мутации, повышения, либо удаления, то формирование опухоли двигателя», сообщил ведущий создатель Пабло Тамайо, врач философии, учитель и соруководитель Сан-Диего UC Геномика Онкологического центра Moores и Вычислительная Биология Неспециализированный Ресурс.

Тамайо и команда удостоверились в надежности REVEALER применение The Cancer Genome Atlas (TCGA), базы данных Национальных Университетов Здоровья геномной информации больше чем от 500 людских опухолей, воображающих большое количество типов рака. REVEALER продемонстрировал генные трансформации, которые связаны с активацией нескольких клеточных процессов, каковые, как мы знаем, играли роль в ответе и развитии опухоли на определенные наркотики.

Кое-какие из этих генных мутаций были уже известны, но другие были новыми. К примеру, исследователи нашли новые активирующие геномные отклонения для бета катенина, продвигающего рак белка, и для окислительного ответа напряжения, что кое-какие случаи рака угоняют, дабы расширить их жизнеспособность.REVEALER – сильный подход, но требует как вход отличные геномные значительное количество и данные образцов рака, каковые смогут быть проблемой, говорит Тамайо.

Но REVEALER более чувствителен при обнаружении неспециализированных линия между разными типами геномных изюминок и менее зависит от упрощения статистических догадок, по сравнению с другими способами, говорит он.«Это изучение демонстрирует потенциал объединения функционального профилирования клеток с чертями геномов рака через упорядочивающее новое поколение», сообщила co-ведущий-автор Джилл П. Месирова, врач философии, учитель и объединенный вице-канцлер для вычислительных медицинских наук в Медицинской школе Сан-Диего UC.

11 комментариев к “Новая компьютерная программа может помочь раскрыть скрытые геномные изменения, которые ведут раковые образования: Проверенный на большой базе данных геномики опухоли, метод REVEALER позволяет исследователям соединять геномику с функцией клетки”

  1. Rockredeemer

    Мудрец читай ВИКИПЕДИЮ-Ме?кка (араб. ???????? Макка, также ??? ??????? — Макка аль-Мукаррама — Благородная Мекка) — город в западной Саудовской Аравии, около 100 км от Красного моря. Является центром паломничества для мусульман (см. Хадж). Немусульманам в Мекку въезд запрещён законом страны.-ТЫ ХОЧЕШЬ как Владимир перекрестить всех в мусульман или запретить запретить всем не ресским посещать ЭТИ земли

Оставьте комментарий