Ученые разрабатывают свободный, генетический инструмент исследования онлайн

«Эта работа в действительности началась, в основном, из-за требования ученых MU», сообщил Цзяньлинь Чэн, адъюнкт-доктор наук информатики в Колледже MU Разработки. «Упорядочивающая РНК есть средствами, которыми исследователи применяют современные упорядочивающие способы, дабы изучить РНК либо рибонуклеиновую кислоту. Процесс увеличил скорость, что исследователи смогут отметить различия в экспрессии гена среди геномов – но это прибывает в цена. Довольно часто, ученые должны просеять через поразительно громадные количества данных, дабы добраться до применимых результатов.

RNAMiner сократил то время решительно».Ченг и докторанты Джилонг Ли и Цзе, Как сотрудничавший с участниками Центра MU Ботанических Изучений Сотрудничества, Разделения Биологических наук, Отдела Химии, Отдела Биохимии, Университета Информатики MU и Центра Наук о жизни Связи, дабы проанализировать широкие геномные комплекты разрешённых и сформулировать дизайн RNAMiner.

Сайт был создан, дабы быть легким в применении и разрешает пользователям загружать эти, разбирать их через целых пять шагов против полных геномов пяти разновидностей: человек, мышь, Дрозофила melanogaster (тип мухи), TAIR10 arabidopsis (мелкое цветущее растение) и Clostridium perfringens (тип бактерии). Геномные эти для любых разновидностей смогут для закачки вырастить базу данных.

В среднем, два гигабайта данных занимает примерно 10 часов для серверов, дабы обработать и проанализировать. Большая часть исследователей приобретает результаты в течение нескольких часов, сообщил Ченг.

«Дабы применять отечественный трубопровод, Вы не должны знать о вычислительных инструментах», сообщил Ченг. «Вы легко должны загрузить файлы и выбрать пара параметров, и это машинально даст те результаты. Применяя это данные, мы можем сжать это по большей части много тысяч времен, кроме того один миллион раз, и установить связи, нужные для отечественных сотрудников, дабы выяснить гены, каковые вызывают заболевании либо определенные черты фабрик и делают кое-какие опыты, дабы проверить их результаты».Бумага, сопровождающая создание сайта, «От Гигабайта до Килобайта: Протокол Биоинформатики для Горной индустрии Громадных Данных RNA-Seq Transcriptomics», сравнительно не так давно был издан в PLoS Один и финансировался частично Национальными Университетами Здоровья (RO1GM093123) и КАРЬЕРНАЯ Премия Национального научного фонда Ченга (DBI1149224).

Содержание – лишь ответственность авторов и не обязательно воображает официальные взоры агентств по финансированию.Сайт свободен применять и возможно отыскан тут: http://calla.rnet.missouri.edu/rnaminer/index.html

11 комментариев к “Ученые разрабатывают свободный, генетический инструмент исследования онлайн”

  1. Валевач Михаил

    На влияние отца Онуфрия может оказать только София Ротару -с одного села они.А так удачи ему и не ходить не под кем- включая Кирилла

Оставьте комментарий