«В этом изучении мы разрабатываем способ упрощения, дабы уменьшить класс в большинстве случаев принимаемых моделей экспрессии гена к математической модели, PDMP, по причине того, что легче проанализировать и моделировать, чем прошлые модели», сообщил Янь Тин Линь, соответствующий прикладной математик и автор исследования в Центре и Теоретическом Подразделении Нелинейных Изучений в Национальной лаборатории Лос-Аламоса.Николас Э. Бачлер из Университета Дюка и Центра Геномной & Вычислительной Биологии, созданной в соавторстве изучение, которое появляется сейчас в издании Royal Society Interface.Лин заявила, что новая модель была самым естественным языком, дабы обрисовать динамику эукариотической экспрессии гена. Математические модели для кинетики химических реакций – в этом случае, процесс экспрессии гена – довольно часто предполагают, что, по причине того, что кое-какие процессы реагируют в намного более стремительных временных рамках, сглаживание может употребляться в качестве аналитической техники.
Но недавние опыты предполагают, что такое стремительное сглаживание может не быть верным.Опыты единственной клетки говорят о том, что экспрессия гена случайная и «пульсирующая», Лин сообщила, особенность, которая может показаться из медленного переключения между странами покровителя с разными действиями. Покровители оказывают помощь отрегулировать экспрессию гена, но как они активированы, и действие кинетики остается неуловимым.
Один источник долговечных стран покровителя – развязывание кинетики и медленное закрепление транскрипционных факторов покровителям. Изучение отыскало, что математическая модель PDMP совершенно верно обрисовывает случайную, либо стохастическую, динамику экспрессии гена в неадиабатическом режиме (где кинетика покровителя медленная, и стремительное сглаживание не имеет возможности случиться).Текущее изучение отыскало, что колебательная динамика могла быть более прочной, чем ранее идея, по причине того, что медленная кинетика покровителя может привести к надёжным колебаниям, каковые не имеет возможности сделать скоро переключающийся покровитель.
«Вероятные механизмы, дабы отрегулировать последовательность колебания, потому, что живой организм развился бы, дабы развивать прочный циркадный ритм либо ежедневные биологические часы, смогут кроме этого быть продемонстрированы от теоретических изучений», сообщила Лин. «Эти догадки заслуживают будущую экспериментальную диагностику».