Инфекционные болезни – один из наибольших убийц в мире. Практически 5 миллионов детей моложе 5 умирают ежегодно от инфекционных болезней во всем мире, все же большое количество зараз излечимы, в случае если патогенный преступник возможно скоро и совершенно верно опознан.«В сфере инфекционных болезней данный тип разработки мог быть столь же большим как упорядочивание генома человека», говорит соавтор Марк Янделл, врач философии, учитель людской генетики в Университете Юты (U U), H.A. & держатель Эдны Беннинг Президентиэл Эндауэд Чэр, соруководитель Центра USTAR Генетического Открытия и учредитель IDbyDNA. «Весьма мало людей унаследовали генетическое заболевание. Но в какой-то момент, все заболели от зараз».
Для заразных вредных микроорганизмов тяжело скрыться, в то время, когда их генетический материал раскрыт. Taxonomer открывает совсем новый подход для диагноза инфекционного заболевания, что ведет сложный геномный вычислительные технологии и анализ. По окончании того, как пример больного упорядочен, эти загружены через Интернет на Taxonomer.
Меньше чем за одну 60 секунд инструмент показывает уменьшенный инвентарь всех вредных микроорганизмов в примере, включая вирусы, бактерии и грибы. Интерактивный, интерфейс пользователя в настоящем времени Taxonomer приведен в воздействие совокупностью IOBIO, созданной лабораторией Габора Марта, DSc, учителя людской генетики в U U и соруководителе Центра USTAR Генетического Открытия.«Отечественные сравнительные анализы производительности показывают Taxonomer, являющийся десять к в сто раз стремительнее, чем подобные инструменты», говорят соавтор Роберт Шлаберг, Мэриленд, врач Мед, MPH, медицинский директор в Лабораториях ARUP и учредитель IDbyDNA. Шлабергу предоставили грант в размере 100 000$ от Фонда и Билла Мелинды Гейтс, дабы применить Taxonomer к уменьшению высоких показателей смертности детей с инфекционными болезнями в параметрах настройки с ограниченными ресурсами.
Schlaberg показывает, что текущее диагностическое тестирование все еще надеется в громадной степени на растущие культуры подозреваемых вредных микроорганизмов в лаборатории, которая есть довольно часто неокончательной и трудоемкой. Кроме того с намного более стремительными тестами как PCR, число вредных микроорганизмов, каковые смогут быть найдены, ограничено.Шлаберг растолковывает, что Taxonomer может выяснить заразу без доктора, имеющего необходимость сделать вывод, что проверить на, что-то, что основанный на PCR тест не имеет возможности сделать. Иначе говоря врач не должен подозревать обстоятельство заразы больного, но может вместо этого , «Что имеет мой больной?» и Taxonomer выяснит вредоносные бактерии.
В новом изучении Taxonomer был проверен с настоящими случаями, применяя эти, изданные вторыми и примерами, обеспеченными Лабораториями ARUP и Центрами по профилактике и контролю болезней (CDC). Taxonomer сделал вывод, что у некоторых больных, каковые продемонстрировали подобные Эболе показатели при недавней африканской вспышке, не было Эболы, но тяжелых бактериальных зараз, каковые, возможно, позвали их показатели. «Эта разработка возможно применена любой раз, в то время, когда мы не знаем суть болезни, включая обнаружение неожиданных вспышек заболевания.
Весьма ясно, что нам безотлагательно нужна более правильная диагностика, дабы существенно расширить свойство клинического ухода и ответа здравоохранения», говорит Сима Джэйн, Мэриленд, медицинский эпидемиолог в CDC.Вторая характерная изюминка Taxonomer – собственная свойство копаться в людской профилировании экспрессии гена, которое предоставляет данные о том, как либо в случае если тело больного реагирует на заразу. «Как клиницист, это дает Вам лучшее представление, в то время, когда мы определяем вредоносная бактерия, есть ли это вправду суть болезни», говорит Кэрри Л. Бйингтон, Мэриленд, учитель педиатрии U U и соруководителя Центра Клинической и Переводной Науки. «Данный инструмент кроме этого разрешит нам определять, отвечает ли больной на бактериальную либо вирусную заразу, в то время, когда мы не находим вредоносная бактерия либо в то время, когда мы находим многократные потенциальные обстоятельства». Она говорит, что видит необыкновенную сокровище этого инструмента для рассмотрения детей, каковые страдают от большего количества страшных для жизни зараз рано в жизни. «Наблюдение, как хозяин [пациент] реагирует, очень полезно; я полагаю, что это – изменение парадигмы в том, как мы диагностируем людей.
Это – из-за чего я желал быть вовлеченным».В прошлой работе, размещённой в Издании Клинической Микробиологии, Шлаберг и его сотрудники показали, что высокая пропускная свойство, упорядочивающая в сочетании с Taxonomer, может точно найти вредоносные бактерии и выяснить ранее скучавшие вредоносные бактерии в терпеливых примерах. «Taxonomer снабжает критический ход вперед, потому, что это очень скоро, совершенно верно, и достаточно легко применять для внедрения в диагностических лабораториях», говорит Шлаберг.