«Это громадное изучение особенно известно тому, что применяло 31 общедоступный геном плюс избранные гены от примерно 90 дополнительных, изолирует», сообщила соответствующий создатель Шерил Каск Научной группы Биоэнергии & Биома в Национальной лаборатории Лос-Аламоса. Работа была размещена в текущей проблеме Прикладной и экологической микробиологии (AEM).
Работа группы включает развитие всестороннего, основанного на геномике их среды и понимания организмов как часть изучения энергобезопасности их источников воздействия и Лаборатории энергии. «Мы совершили обычный сингл и мультигенные сравнения с подходами целого генома и распознали потенциальные факторы ядовитости, дабы отличить новые разновидности из более классического комплекта. Благодаря координации с Центрами по профилактике и контролю болезней (CDC) у нас сейчас имеется структура, дабы выяснить новый, изолирует либо экологические обнаружения, даже в том случае, если лишь частичная информация дешева», сообщил Каск.
Люди смогут легко заболеть туляремией через непредвиденный контакт с зараженными зайцами, кошками, грызунами либо вторыми животными (и клещи либо блохи, каковые смогут быть на них). Заболевание проявляет во множестве форм: холода и лихорадка с болью в суставах, кашлем либо пневмонией, либо болью в животе и бедствием. Коэффициенты смертности находятся, в зависимости от формы заболевания, от 2 процентов до 24 процентов, по данным CDC. Из-за данной серьезности, CDC сделала туляремию заслуживающей публикации заболеванием, и как вредоносные бактерии, вызывающие сибирскую язву и чуму, это вычисляют биооружием.
Через подробные сравнения генома другие выравнивания инструменты и алгоритмы последовательности биоинформатики трудятся на персональных компьютерах Лос-Аламоса, команда Лос-Аламоса выяснила изюминке, каковые дифференцируются среди F. tularensis, и второй новый клинический и экологический Francisella изолирует, снабжая базу знаний для сравнения новых последовательностей из клинических либо экологических обзоров.«Для обитателей областей, таких как Юго-запад, где вспышки туляремии местные и опасные для жизни, наличие большего количества идентификационных инструментов под рукой очень полезно», сообщил Каск.
Распределение их изолирует, глобально, но, предлагая интернациональное распределение организмов Francisella, каковые населяют рыбу, клещей и множество экологических источников.Команда назначила четыре новых группы разновидностей в роду; Francisella opportunistica, оппортунистический вредоносная бактерия свободных скомпрометированных больных; соляное озеро Francisella и Francisella uliginis, экологический, изолируют от прибрежной морской воды под Галвестоном, Техас; и Francisella frigiditurris от воды градирни в Калифорнии.
Геномное упорядочивание финансировалось американским Министерством нацбезопасности, Управлением Науки и техники.