«Мы не знаем функции этого гена, и мы не знаем, сколько у других организмов имеется гены как это», сообщил Джон Брэчт, доцент биологии в американском университете.Bracht возглавил команду студентов на проекте геномики.
Мысль случилась, в то время, когда он начал собственную лабораторию в AU в 2014 и добрался до беседы о необыкновенной геномике зебровой амадины с Колином Солдэнхой, сотрудником и соавтором на изучении. Солдэнха – нейробиолог AU, что обучается, как эстроген защищает мозги зебровых амадин от страшного воспламенения по окончании травматического повреждения.
Оба ученых дали согласие, что будет стоить постараться упорядочить загадочную дополнительную хромосому в зародышевой линии певчих птиц.Работа началась три года назад, и с того времени, Брэчт и его студенты привыкли вычислительную биологию для последовательности, вида и фильтруют генетические эти, полученные из зябликов Салданьи.
Они решили упорядочить РНК, по причине того, что большое количество ДНК возможно весьма повторяющимся, и большинство его не употребляется для белка, кодирующего нужный для генных функций. РНК воображала меньшую цель, в которой возможно отыскать малоизвестный ген малоизвестной хромосомы, сообщил Брэчт.Bracht и его студенты начали процесс собрания с 167 929 берегов РНК, в конечном итоге провеяв вниз, что число при помощи проверки и вычислительного процесса трудится в лаборатории к восьми белкам, один из которых они подтвердили как первый ген на ограниченной зародышевой линией хромосоме, что они назвали ‘GRC α – SNAP’.
Это – захватывающая находка по причине того, что GRC α – SNAP – часть семьи SNAP, гены, очень важные для мембранного сплава в нейробиологии и вне. То, что данный новый ген SNAP отыскан лишь в зародышевой линии срочно, предлагает пара направлений и потенциальных функций для опытов.Другие результаты от процесса фильтрации нужны в заполнении промежутков биологии зяблика.
В то время, когда геном зебровой амадины был упорядочен в 2010, кое-какие гены были пропущены. Команда AU выяснила 936 из этих недостающих белков включая второй ген SNAP вне GRC α – SNAP.
Это делает зебровую амадину первым известным организмом, дабы продемонстрировать дупликацию гена для данной семьи SNAP генов.Помимо этого, эволюционный анализ продемонстрировал GRC α – SNAP развился для хорошего выбора – эволюция для трансформаций ее последовательности белка, а не выбор, дабы поддержать статус-кво. Это наводящее на размышления об эволюции к функции, но намного больше изучения будет нужно, дабы выяснить то, что та функция и из-за чего это существует.
Сейчас команда может думать: к примеру, ясный генетический детерминант пола отсутствует у птиц. Ген имел возможность играть роль в определении пола?«Открытие GRC α – SNAP приводит к вопросам об определении пола у зебровой амадины и возможности, что это – часть того, что делает птицу женского пола дамой, вероятно вниз по течению при помощи генетического выражения в яичниках», сообщил Брэчт.
Следующие шаги включают упорядочивание ДНК и изучение изучений функциональности у зебровой амадины.Содействием авторов бумаге есть Мишель Бидермен, Меган Нельсон, Кэтрин К. Асалоун, Алисса Педерсон и Колин Солдэнха.
Бумага онлайн сейчас в Текущей Биологии.