Всесторонний поиск в базах данных генетических вариаций не выявил существенных различий между популяциями и этническими группами в семи генах, связанных с проникновением вируса SARS-CoV-2.
Афроамериканцы и латиноамериканцы в Соединенных Штатах и этнические меньшинства в Соединенном Королевстве непропорционально сильно страдают от COVID-19. У них более вероятно развитие тяжелых симптомов, а также значительно более высокая смертность по сравнению с другими региональными и этническими группами.
Чтобы выяснить, может ли это несоответствие быть вызвано генетической изменчивостью, группа из трех исследователей, в том числе доцент Джи-Вон Ли из Высшей школы стоматологической медицины Университета Хоккайдо, провела обзор общедоступных баз данных геномных вариантов, включая gnomAD, Корейскую базу данных эталонных геномов. , TogoVar (японская база данных генетических вариаций) и проект «1000 геномов». Они изучили варианты семи генов в нескольких региональных и этнических группах, которые, как известно, играют роль в проникновении вирусов в клетки-хозяева и распознавании вирусной РНК в клетках-хозяевах.
SARS-CoV-2 содержит белок (S-белок) на своей оболочке, который окружает вирус. Прежде чем вирус сможет проникнуть в клетки-хозяева, белок S должен связаться с рецептором ACE2 на поверхности клетки. Затем он расщепляется на две части ферментами TMPRSS2 и катепсином B и L. После того, как вирус попадает в клетки, вирусная РНК связывается с белками, такими как TLR3, TLR7 и TLR8, вызывая врожденный иммунный ответ.
Согласно результатам, в этих семи белках были генетические варианты, при этом наибольшее количество вариантов было в ACE2. Однако очень немногие из этих вариаций изменяют функции этих белков. Поскольку общая частота вариаций была чрезвычайно низкой (менее 0.01%), ученые определили, что между популяциями или этническими группами нет значительных различий в функциях семи белков, участвующих в инфекции.
Результаты исследования показывают, что различия в заболеваемости и смертности не являются результатом генетических вариаций генов проникновения вирусов в разные популяции. Скорее, более вероятно, что существовавшие ранее заболевания, индивидуальные истории болезни, факторы окружающей среды и различия в медицинском обслуживании играют значительную роль в влиянии на заболеваемость и смертность от COVID-19. Однако из-за ограниченного размера популяционных баз данных, используемых в этом исследовании, требуются дополнительные исследования с использованием более разнообразных баз данных генома человека. Кроме того, другие исследования показали, что генетические факторы могут способствовать возникновению серьезных случаев.