Тогда как производитель Quorn™ развивает напряжения Fusarium venenatum через брожение в mycoprotein тесто для потребления человеком, фермеры пробуют отбить Fusarium graminearum, потому, что данный распространяющийся грибковый вредоносная бактерия вторгается в многократные зерновые культуры и угрожает глобальной продуктовой безопасности.Исследователи сейчас совершенно верно выяснили пара значительных различий между грибковой парой, каковые, думается, поворачивают F. graminearum неприятный, особенности, каковые обещают цели управления заболеванием. О итогах, командой от Изучения Rothamsted, информируют сейчас в издании, Геномике BMC.Команда нашла, к примеру, что F. venenatum не содержит кое-какие группы генов, каковые создают вспомогательные комплексы либо вторичные метаболиты, каковые произведены F. graminearum на протяжении успешной заразе пшеницы.
«Применяя улучшенное ПО, мы увеличили генные и вторичные предсказания кластера генов метаболита в обеих разновидностях к уровню, не отысканному в большинстве вторых волокнистых грибковых разновидностей», говорит Роберт Кинг, преимущество команды bioinformatician в Rothamsted.Подчеркивая важность результатов, Король отмечает: «Все эти улучшенные эти срочно дешёвы в публичном достоянии через ENSEMBL [база данных генома]. В среднесрочной возможности должно быть вероятно достигнуть эластичной стратегии управления для этого глобально ответственного, передающего хлопья вредоносной бактерии».
Команда кроме этого подтвердила различия в сцепляющихся стратегиях, в особенности что патогенный гриб может спариваться с собой, что воздействует на перенос генов между механизмами ремонта и поколениями генома, в то время как гриб Quorn™ должен был бы отыскать ассистента.И они нашли, что главные области в хромосомах, centromeric регионах, на 25% меньше в мягком грибе по невыясненым обстоятельствам, но каковые предлагают «отличную отправную точку для расследований», отмечает Ким Хэммонд-Козэк, молекулярный патолог завода в Rothamsted и фаворит исследовательской группы.
«Это – ответственная и захватывающая обрабатываемая подробность, которая показывает большое количество различий между F. venenatum и вредным микробом завода F. graminearum на многих различных уровнях», говорит Роб Джонсон, специалист и менеджер Науки по Брожению в Продуктах Quorn.«Не обращая внимания на тесную сообщение, продемонстрированную упорядочиванием», продолжает Джонсон, «различия в образе судьбы написаны глубоко в геномы этих грибов с saprophytic F. venenatum показ диапазона генов, посвященных распаду органического вещества, в то время как F. graminearum содержит неповторимые гены для вторичных метаболитов и более посвященный его патогенному характеру».
Джонсон додаёт: «Подтверждение непатогенной природы разновидностей раньше делало Quorn™, и познание генетики, продемонстрированной этими данными, сделает данную статью той, к которой будет возвращаться Quorn™ неоднократно, потому, что мы улучшаем отечественный процесс и выращиваем отечественный бизнес».В отдельном изучении, кроме этого финансируемом в Rothamsted Биотехнологией и Научном совете Биологических наук, команда распутывала пан-геном F. graminearum, справочный геном, что включает генетический состав вредоносной бактерии и кроме этого тех из его разных напряжений.
«Мы можем сейчас срочно выяснить, какой из сравнительно не так давно предсказанных вторичных кластеров генов метаболита и мелких запрятавших последовательностей аккуратного элемента белка отыскан во всех патогенных напряжениях F. graminearum», говорит Хаммонд-Kosack.«Эти последовательности тогда становятся целями намного более узкого комплекта последующих изучений функции гена в F. graminearum обратным генетическим экспериментированием, дабы определить гены, ответственные для вызывающих заболевание свойств этого вредоносной бактерии».
Хаммонд-Kosack завершает: «Начинаясь с фундаментального нового знания, взятого от этих изучений, стабильное обнаруживает, и трубопровод борьбы с заболеваниями начал создаваться».